Am 20. April listete der armenische Premierminister Nikol Paschinjan die Kirche unter den Gruppen auf, von denen er sagte, dass sie verärgert über seine Regierung seien, berichtete der  armenische Dienst von Radio Free Europe. 

Er behauptete, dass die Politik der Regierung „sehr ernsthafte Enttäuschungen“ unter den Geistlichen hervorruft, weil sie einen „Mangel an geistlichem Leben in Armenien“ aufdeckt. Er beschuldigte die Kirche auch, sich häufig in die Politik einzumischen und „politische Intrigen“ auszubrüten, anstatt sich auf „Aktivitäten einzulassen, die sich aus der Bibel und ihrer Ideologie ergeben“. 

Das in Etschmiadsin ansässige Büro von Katholikos Garegin II., antwortete, dass es mit Paschinjans „Bewertungen“ nicht einverstanden sei. Die Kirche werde aber diese Äußerungen nicht weiter kommentieren, da das Land kurz vor dem 105. Jahrestag des Völkermords an den Armeniern im Osmanischen Reich stehe.  

Am 14. April erklärte Garegin II., die zuständigen Behörden des Landes sollten den ehemaligen Präsidenten des Landes, Robert Kotscharjan, entlassen, um „weitere Komplikationen seines Gesundheitszustands“ während der Coronavirus-Pandemie zu vermeiden. Einen Tag später erklärte Paschinjans Sprecher Mane Gevorgjan, dass die Regierung nicht beabsichtige, sich zu den „Hoffnungen und Wünschen“ des Katholikos zu äußern. Der stellvertretende Parlamentssprecher Alen Simonjan beschuldigte den Katholikos, Druck auf armenische Gerichte auszuüben. Er ging noch weiter und sagte, dass Tausende von Bürgern es für notwendig halten, den Katholikos auszutauschen.

Am selben Tag, als die Konfrontation begann, wurde eine Anklage gegen den Vikar der Patriarchalischen Diözese Ararat, Erzbischof Navasard Ktchojan, wegen Geldwäsche aus dem Jahr 2010 erhoben (Caucasus Watch berichtete).